Większość spotykanych na rynku czytników pozwala wyświetlać tekst i obrazy oraz odtwarzać nagrania. Wśród obsługiwanych formatów znajdują się między innymi:
  • pliki tekstowe (.txt) jest to zwykły, niesformatowany tekst. Żadne elementy nie są wyróżnione: nagłówki i tytuły wyglądają tak samo, jak reszta tekstu. Dokumenty tekstowe dobrze wyświetlają się na ekranie, strony zmieniają się szybko, ale niektóre urządzenia mogą nie wyświetlać poprawnie polskich znaków;
  • dokumenty sformatowane (.pdf) format PDF został opracowany przez firmę Adobe Systems, a następnie uznany przez organizację ISO jako standard wymiany dokumentów (Portable Document Format – format dokumentu przenośnego). Najważniejszą cechą jest zachowanie formatowania, co oznacza, że dokument PDF wygląda tak samo na każdym urządzeniu: komputerze, drukarce, plotterze itp. Zachowane są czcionki, wygląd tytułów i nagłówków, rozmiar i umiejscowienie rysunków. Niestety, to co jest zaletą w przypadku komputerów – niekoniecznie musi się sprawdzać na czytnikach elektronicznych. Na małych ekranach tekst może być nieczytelny, a przy powiększeniu strona przestaje się mieścić na ekranie, przez co czytanie przestaje być wygodne. Ponadto, przewijanie stron może się zauważalnie wydłużać w przypadku bardziej złożonych dokumentów;
  • mobipocket (.prc): to obecnie najbardziej popularny format stosowany w e-książkach. Stworzony w roku 2000 przez francuską firmę Mobipocket SA aby umożliwiać dystrybucję cyfrowych książek na przenośne organizatory (PDA), smartfony oraz e-czytniki. Inaczej niż w przypadku pdf, czytelnik może sam wybrać rodzaj i wielkość czcionki a tekst dopasowuje się automatycznie do wielkości ekranu. W rezultacie ten sam dokument może inaczej wyglądać na różnych urządzeniach. Dokument zawiera podstawową informację o formatowaniu tekstu – paragrafach, nagłówkach, wyróżnieniach – co z kolei odróżnia go od formatu tekstowego. Publikacje w formacie mobipocket mogą być zabezpieczone przed kopiowaniem na inne urządzenia, dlatego format ten jest chętnie wybierany przez wydawców elektronicznych książek.
  • EPUB (Electronic PUBlication) jest standardem zalecanym przez stowarzyszenie IDFP (International Digital Publishing Forum – Międzynarodowe Forum Wydawnictw Cyfrowych). Jest to darmowy i otwarty format oparty na opisie XHTML. Podobnie jak w przypadku mobipocket, dokument zawiera podstawowe informacje o formatowaniu a tekst automatycznie dopasowuje się do rozmiarów wyświetlacza. Mimo, że oferta cyfrowych książek w formacie EPUB jest dziś uboższa niż mobipocket, znaczenie tego standardu rośnie i kolejni producenci włączają jego obsługę do swoich urządzeń. E-książki w formacie EPUB mogą być ogólnie dostępne lub zabezpieczone przed kopiowaniem specjalną technologią firmy Abobe Systems.
  • fictionbook (.fb2) to otwarty format oparty na opisie XML stosowany do zapisu ebooków, szczgólnie popularny w Rosji. Nie jest to specyfikacja wyglądu dokumentu, ale raczej opis jego struktury: rodziałów, paragrafów, wyróżnień itp. za pomocą odpowiednich znaczników. Z tego względu, format ten może być stosowany jako materiał wyjściowy do kowersji na inne formaty (epub, mobipocket itp.).
  • pliki graficzne (.jpg, .png, .tiff, .bmp) czytniki mogą wyświetlać zdjęcia i obrazy, jednak ze względu na ograniczenia technologii e-papieru prezentowane obrazy są przedstawione jedynie w odcieniach szarości.
  • pliki dźwiękowe (.mp3) czytniki mają tez możliwość odtwarzania na słuchawkach plików dźwiękowych. Dzięki temu, czytając możemy słuchać muzyki. Można też, zamiast czytania tradycyjnej książki, wysłuchać książki dźwiękowej – tak zwanego audiobooka.